ISOMer et recherches sur les microalgues

Des recherches sont menées par ISOMer sur des aspects écologique et fondamentaux sur les microalgues des environnements marins, en collaboration avec le LS2N, l’US2B, le LPG, l’Osuna, le GEPEA et des laboratoires du site nantais de l’Ifremer : 

• des projets incluant sciences participatives et développement d’outils informatiques d’exploitation d’imagerie (drones, satellites) pour la compréhension des mécanismes de survenue des efflorescences de microalgues toxiques. D’autres projets utilisant la télédétection hyperspectrale ont récemment abouti à la mise en ligne d’une première cartographie européenne des biofilms et herbiers des zones intertidales. 
• des projets financés au niveau européen sur l’impact anthropique et du changement climatique sur le fonctionnement des biofilms des vasières côtières : étude de leur rôle dans les flux de CO2 et comme puit de carbone.
• des projets en écologie chimique des holobiontes microalgaux : ici, ce sont les interactions chimiques entre microalgues et d’autres microorganismes tels que des bactéries ou des champignons qui leur sont associés au sein du microbiome marin qui sont investiguées.

Si la thématique est très fondamentale, ces travaux précurseurs dédiés à la découverte des petites molécules de communication qui régissent leur mutualisme pourront également aboutir à l’identification de molécules antimicrobiennes pour la thérapeutique ou à l’optimisation des rendements de production de lipides d’intérêt. Pour cela, ISOMer s’appuie sur sa plateforme ThalassOMICs d’analyse métabolomique par spectrométrie de masse, intégrée à la méta-plateforme Corsaire de Biogenouest.